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更新時間：2013-11-07 
瀏覽次數：1658生活中常聽到這樣的對話：張家閨女真漂亮，和她媽一模一樣；李家兒子小眼睛，像他爸。張媽媽到底是不是“無功空受祿”，而李爸爸又有沒有蒙受“不白之冤”？有了本文的新技術，一切自有分曉。當然，這只是玩笑。正如文中所說，新技術的真本事，在于評估染色體病患病風險等方面。舉個例子，具有較高患癌風險的人通常有多個DNA突變，新技術能確定這些突變是否來自同一條染色體，如果是，患病風險將會降低，因為正常的那條染色體往往可以補償突變的影響。同樣道理，這項技術也會讓器官移植配型更迅捷準確。
一項新技術成功地解決了DNA測序中長期存在的一個挑戰：確定一段特殊的遺傳序列是來自于個體的母親或是父親。加州大學圣地亞哥分校Ludwig癌癥研究所的研究人員，在發表于11月3日《自然生物技術》雜志上的一項研究中詳細描述了這一方法，其有望推動研究基因導致疾病的機制，改進供體與器官的配型過程，幫助科學家們更好地了解人類的遷移模式。
領導這一研究的是加州大學的華人科學家任兵（Bing Ren）教授，其早年畢業于中國科技大學，現為加州大學圣地亞哥分校Ludwig癌癥研究所基因調控實驗室主任，其主要從事哺乳動物細胞基因調控網絡分析及細胞表觀遺傳學調控機制的研究。近年來在Science、Nature,、Cell雜志上發表了一系列重要的研究成果。 任兵說：“這一技術將使得研究醫生能夠更好地評估個體的疾病風險。它有可能改變個體化醫療。”這項新技術被命名為“\"HaploSeq”。
任兵說：“當前的測序技術非常的快速，并且正迅速變得越來越便宜——現在測序一名個體的基因組僅需大約1周時間，花費5,000美元。在不久的將來，每個人的基因組都會被測序。這將成為一種醫療標準。但一直以來這一方案存在一個問題。除了性染色體，每個人的每條染色體都具有兩個拷貝。一個拷貝來自母親，另一個拷貝來自父親。當前的技術不能區分每個基因的兩個拷貝，因此不能很好地確定特殊的遺傳差異，例如DNA的單堿基改變，是起源于個體的母親或是父親——使得遺傳分析結果含混不清。
任兵的新技術組合了分子生物學和計算生物學方法，繞過了這一問題。這一方法使得研究人員能夠快速確定哪些遺傳變異共同發生在同一染色體片段上，因此來自于同一親緣。“這一突破對于在研究實踐中利用基因組學具有直接的意義，對于遺傳研究和發現也具有深遠的影響，”Ludwig癌癥研究所研究人員Siddarth Selvaraj說。
更直接的影響是，這項技術將使得研究醫生能夠更好地評估個體的疾病風險，這是個體化醫療的基石。例如，癌癥的風險人群往往具有一個以上的DNA突變。HaploSeq能夠使得研究醫生確定兩個突變是存在于相同的染色體上或是在不同的染色體上，從而有助于風險評估。例如，如果兩個突變存在于相同的染色體上，由于“好”的染色體往往可以進行補償，從而有可能降低風險。
同樣，隨著進一步地改良，這一方法還有可能改進當前確定器官供體與受體之間遺傳配型的繁瑣過程。大量的基因有助于供體與受體之間相容，但在這些基因中存在有許多的遺傳變異。新技術有可能幫助確定供體和受體之間的DNA差異是否可能是一種良好的匹配。任兵說：“這將需要開展更多的研究，通過建立一個DNA數據庫，有可能更、更便捷地將受體與供體進行配對。”
新方法還將有助于研究人員分析人類的遷移，根據他們的DNA序列來確定祖先。任兵說：“原則上，你可以將你的遺傳序列與你的鄰居的遺傳序列進行比較，探求你們是否具有共同的近代祖先。采用我們的技術能夠研究每個個體以及他們與其他個體的關系。隨著我們不斷地累積來自大量個體的數據，我們將能夠更地確定他們的關系。”這樣的研究結果也將推動當前正在開展的一項研究HapMap計劃評估*的人類遺傳變異。
這一新技術的一個優勢在于，它是建立在一些常用測序技術之上，應該很容易被研究醫生和研究人員所利用。任兵說：“我預計這一新方法將得到相當廣泛的應用。”
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